La maestría está estructurada en 5 ejes de formación, que se van abordando a los largo de los 6 trimestres que dura la maestría.
Los ejes son: Ciencia Tecnología Sociedad, Economía, Político, Planificación y gestión, y Seminario de tesis.
Estos ejes se complementan con materias un grupo de materias optativas que tienen como fin, complementar y/o profundizar algunos de los temas vistos en los cursos obligatorios.
Los cursos están organizados bajo la modalidad de aula invertida on line. Esta modalidad, está apoyada en el uso de diferentes plataformas colaborativas, y en una combinación equilibrada de clases sincrónica y asincrónicas.